‘My Mister’ mengisahkan tentang seorang gadis bernama Lee Ji An (diperankan oleh IU) yang hanya berusaha bertahan dalam hidup. Ia selalu mendapati nasibnya yang malang dan jarang mendapatkan suatu hal yang baik.
Dia merawat neneknya yang lemah serta melakukan banyak pekerjaan paruh waktu. Bahkan ia merasa lelah dengan hidupnya dan mengalami depresi. Tapi semuanya mulai berubah ketika dia bertemu Park Dong Hoon (diperankan oleh Lee Sun Gyun), seorang pekerja kantoran yang optimis dan penuh kasih. Dia yang melihat Ji An mencoba untuk membantunya.
Saat bertemu dengan Park Dong Hoon, Ji An melihat cara dia memandang dunia dan mulai berubah. Dia membantunya tanpa mengharapkan imbalan apa pun, yang tidak pernah dimiliki Ji An dalam hidupnya. Dengan bimbingannya, dia menyadari bahwa hidup bahagia itu mungkin.